Seiring berkembangnya teknologi biologi molekuler, Next-Generation Sequencing (NGS) telah menjadi alat utama dalam analisis genom. NGS memiliki peran krusial dalam memajukan penelitian genom. NGS telah menjadi tonggak penting dalam bidang biologi molekuler, memungkinkan pemahaman lebih mendalam tentang struktur genom dan variasi genetik. Untuk memberikan pemahaman mendalam tentang teknologi ini, workshop sequencing NGS menjadi sarana efektif bagi para peneliti dan profesional di bidang biologi molekuler.

Pada tanggal 21-23 Februari 2024, Pusat Studi Biosystem bersama dengan Yayasan Satya Budhi Dharma Setya menyelenggarakan Workshop dengan topik “Whole Genome Sequencing and NGS Bioinformatics Data Analysis”. Workshop ini diikuti oleh mahasiswa dan dosen dari berbagai Universitas di Indoensia. Harapannya Workshop ini dapat memberikan peserta pemahaman yang komprehensif tentang teknologi NGS dan metode analisis datanya. Workshop di selenggrakan di Gedung Biologi Molekuler, Departement Biologi, Fakultas MIPA, Universitas Brawijaya dan didukung penuh oleh Yayasan Satya Budhi Dharma Setya (Gambar 1).

Gambar 1. Pelaksanaan kegiatan Workshop “Whole Genome Sequencing and NGS Bioinformatics Data Analysis” yang diikuti oleh mahasiswa dan dosen di berbagai universitas yang ada di Indonesia.

Salah satu peserta Workshop yaitu Ainun Sayyidah Zakiyah, M.Si dari Universitas Brawijaya menyatakan bahwa Genom makhluk hidup memiliki potensi yang sangat besar untuk dianalisis. Melalui analisis metagenomik kita dapat melakukan identifikasi secara langsung suatu populasi mahkluk hidup yang berada di lingkungan. Besarnya keanekaragaman makhluk hidup membutuhkan tools yang tepat untuk analisis yang akurat dan komprehensif. Beliau berharap melalui Nanopore, proses analisis metagenomic dapat dilakukan dengan waktu relative singkat dan dapat menghasilkan data yang akurat.

Beberapa peserta workshop yang lain juga mendapatkan pengalaman menarik setelah mengikuti workshop tersebut, diantaranya yaitu Ibu Suci dari fakultas kedokteran Universitas Brawijaya. Ibu Suci berpendapat bahwa “workshop ini sangat bermanfaat bagi kami sebagai pengguna jasa lab service NGS karena membantu memberikan gambaran bagaimana peneliti harus menyediakan sample yang sesuai dengan requirement agar hasil sequencing bagus dan mengintepretasikn hasil dari sofware tidak hanya tentang pengolahan hasil sequencing namun juga data tambahan annotation yang memberikan masukan tentang functional prediction”.

Melalui kegiatan ini diharapkan para peserta dapat memahami mengenai teknologi NGS dan metode analisis datanya dalam analisis genom dan variasi genetik.Walaupun NGS merupakan suatu metoda terkini dalam sekuensing tetapi hasil akhir analisis NGS memerlukan sekuensing sanger sebagai konfirmasi atau validasi hasil akhir yang didapat sehingga hasil analisis data NGS baru merupakan prediksi dan harus divalidasi dengan sekuensing sanger. Data NGS dapat digunakan dalam beberapa topik penelitian seperti metagenomik, genomik kanker, epidemiologi genomik, epigenomik, variasi gen manusia.

Editor:     Rezekinta Syahputra Sembiring